Preguntas con etiquetas [snakemake]

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490
modo de emacs para snakemake?
Publicado el 15/06/2013 a las 20:08
por usuario user2489449
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89
error de puntero nulo y variable no definida
Publicado el 11/08/2015 a las 10:03
por usuario Marcel M
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476
Problemas con los pandas instalan - ejecutar varias versiones de Python
Publicado el 24/08/2015 a las 10:52
por usuario rioualen
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66
Bucle a través de listas de archivos con Bash - error de sintaxis
Publicado el 31/08/2015 a las 14:40
por usuario rioualen
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537
Ejecutar siempre en regla Snakefile (snakemake)
Publicado el 08/04/2016 a las 07:05
por usuario Chris
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202
la programación de tuberías en paralelo
Publicado el 17/06/2016 a las 15:21
por usuario VickiT05
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Proceso de múltiples directorios y todos los archivos dentro usando snakemake
Publicado el 21/06/2016 a las 17:27
por usuario VickiT05
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776
Re-escritura de archivos protegidos contra escritura
Publicado el 29/06/2016 a las 10:04
por usuario VickiT05
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231
¿Es posible obtener yapf ignorar partes de un archivo?
Publicado el 08/07/2016 a las 04:49
por usuario The Unfun Cat
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69
¿Por qué establecer `wildcard_constraints` en un snakefile prevenir el borrado de archivos marcados` temp`?
Publicado el 26/10/2016 a las 08:12
por usuario bli
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466
Cómo hacer expandir un parcial en Snakemake?
Publicado el 03/11/2016 a las 06:37
por usuario bli
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291
Snakemake puede evitar ambigüedades cuando dos caminos diferentes reglas pueden generar una salida dada?
Publicado el 09/11/2016 a las 12:19
por usuario bli
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86
El uso de "snakemake --config" pasar opciones a un comando
Publicado el 09/11/2016 a las 12:53
por usuario user3213137
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Nombre de la regla en lugar de archivo de destino: Snakemake
Publicado el 10/11/2016 a las 20:08
por usuario blaurent
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115
¿Cómo expresar reglas explícitas e implícitas en Snakemake?
Publicado el 13/11/2016 a las 07:13
por usuario Stephan
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237
El acceso a los archivos creados por normas snakemake log
Publicado el 15/11/2016 a las 02:49
por usuario Andreas
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656
¿cómo puedo pasar una cadena en el archivo de configuración en la sección de salida?
Publicado el 17/11/2016 a las 21:27
por usuario olala
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517
snakemake: cómo hacer frente a un número variable de salida de una regla
Publicado el 18/11/2016 a las 18:04
por usuario olala
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41
Bioconda: simulate-travis.py falla porque API no se puede importar de conda_build
Publicado el 20/11/2016 a las 23:28
por usuario Andreas
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95
Prevenir snakemake de hacer directorio de salida
Publicado el 21/11/2016 a las 18:36
por usuario Harold
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57
bioconda: No existe el fichero o directorio caliente con especias y construcción
Publicado el 22/11/2016 a las 12:39
por usuario Andreas
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213
Snakemake config clúster en combinación con DRMMA
Publicado el 23/11/2016 a las 13:43
por usuario fitziano
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346
Snakemake: dependencias que no son de entrada
Publicado el 25/11/2016 a las 07:27
por usuario blaurent
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96
Snakemake se queja de que no puede encontrar el archivo que se supone que crear en un plazo de instrucciones
Publicado el 02/12/2016 a las 13:09
por usuario bli
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snakemake: ¿hay una forma de especificar un directorio de salida para cada regla?
Publicado el 02/12/2016 a las 18:40
por usuario olala
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182
El nombre de la corriente de regla en Snakemake
Publicado el 05/12/2016 a las 10:59
por usuario glihm
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293
Snakemake: eliminar el archivo de salida
Publicado el 06/12/2016 a las 10:30
por usuario blaurent
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363
La reutilización de una regla en Snakemake
Publicado el 06/12/2016 a las 13:17
por usuario glihm
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49
Instalación snakemake sin internet
Publicado el 11/12/2016 a las 15:36
por usuario MichelleN
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84
Snakemake + tmux
Publicado el 11/12/2016 a las 16:26
por usuario domino55
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150
cuestiones LSF snakemake
Publicado el 13/12/2016 a las 09:38
por usuario naamako
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139
Snakemake las mejores prácticas para la demultiplexación
Publicado el 14/12/2016 a las 02:57
por usuario kdmurrray91
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510
Cómo utilizar expandirse en snakemake cuando no se desean unas combinaciones particulares de comodines?
Publicado el 16/12/2016 a las 10:31
por usuario bli
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47
Elegantemente manejar muestras con datos insuficientes en el flujo de trabajo?
Publicado el 20/12/2016 a las 16:57
por usuario Jon
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56
Definición de funciones para Geany "Tipo de archivo"
Publicado el 04/01/2017 a las 10:59
por usuario Gil Hornung
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299
El uso de expresiones regulares en snakemake comodines
Publicado el 04/01/2017 a las 11:07
por usuario rioualen
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123
Generar un número parametrizado de OutputFiles para una regla snakemake
Publicado el 12/01/2017 a las 14:49
por usuario vtrubets
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99
bibliotecas Globalmente carga R en Snakemake
Publicado el 13/01/2017 a las 14:01
por usuario Zuup
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428
Como llegar a la ruta del directorio de trabajo?
Publicado el 16/01/2017 a las 08:52
por usuario rioualen
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307
El procesamiento por lotes: GNU-haga, Snakemake o qué?
Publicado el 17/01/2017 a las 10:55
por usuario Robyc
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453
usar múltiples parámetros en snakemake
Publicado el 20/01/2017 a las 13:16
por usuario Kam Sen
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247
Snakemake: Orden aleatorio de comodines en la lista de comodines
Publicado el 27/01/2017 a las 13:40
por usuario Zuup
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106
Reutilización reglas y evitar CyclicGraphException con snakemake
Publicado el 15/02/2017 a las 13:08
por usuario bli
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475
Snakemake: el uso de expresiones regulares en ampliar ()
Publicado el 21/02/2017 a las 07:44
por usuario Zuup
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246
Snakemake: MissingInputException en la tubería snakemake
Publicado el 06/03/2017 a las 12:42
por usuario Mesmer
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461
¿Cómo obtener el nombre base de los valores comodín en la regla de salida snakemake?
Publicado el 08/03/2017 a las 12:27
por usuario Veera
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