Preguntas con etiquetas [snakemake]

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490
modo de emacs para snakemake?
Publicado el 15/06/2013 a las 18:08
por usuario user2489449
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89
error de puntero nulo y variable no definida
Publicado el 11/08/2015 a las 09:03
por usuario Marcel M
Publicado el 24/08/2015 a las 09:52
por usuario rioualen
Publicado el 31/08/2015 a las 13:40
por usuario rioualen
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537
Ejecutar siempre en regla Snakefile (snakemake)
Publicado el 08/04/2016 a las 06:05
por usuario Chris
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202
la programación de tuberías en paralelo
Publicado el 17/06/2016 a las 14:21
por usuario VickiT05
Publicado el 21/06/2016 a las 16:27
por usuario VickiT05
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776
Re-escritura de archivos protegidos contra escritura
Publicado el 29/06/2016 a las 09:04
por usuario VickiT05
Publicado el 08/07/2016 a las 03:49
por usuario The Unfun Cat
Publicado el 26/10/2016 a las 07:12
por usuario bli
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466
Cómo hacer expandir un parcial en Snakemake?
Publicado el 03/11/2016 a las 04:37
por usuario bli
Publicado el 09/11/2016 a las 10:19
por usuario bli
Publicado el 09/11/2016 a las 10:53
por usuario user3213137
Publicado el 10/11/2016 a las 18:08
por usuario blaurent
Publicado el 13/11/2016 a las 05:13
por usuario Stephan
Publicado el 15/11/2016 a las 00:49
por usuario Andreas
Publicado el 17/11/2016 a las 19:27
por usuario olala
Publicado el 18/11/2016 a las 16:04
por usuario olala
Publicado el 20/11/2016 a las 21:28
por usuario Andreas
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95
Prevenir snakemake de hacer directorio de salida
Publicado el 21/11/2016 a las 16:36
por usuario Harold
Publicado el 22/11/2016 a las 10:39
por usuario Andreas
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213
Snakemake config clúster en combinación con DRMMA
Publicado el 23/11/2016 a las 11:43
por usuario fitziano
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346
Snakemake: dependencias que no son de entrada
Publicado el 25/11/2016 a las 05:27
por usuario blaurent
Publicado el 02/12/2016 a las 11:09
por usuario bli
Publicado el 02/12/2016 a las 16:40
por usuario olala
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182
El nombre de la corriente de regla en Snakemake
Publicado el 05/12/2016 a las 08:59
por usuario glihm
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293
Snakemake: eliminar el archivo de salida
Publicado el 06/12/2016 a las 08:30
por usuario blaurent
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363
La reutilización de una regla en Snakemake
Publicado el 06/12/2016 a las 11:17
por usuario glihm
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49
Instalación snakemake sin internet
Publicado el 11/12/2016 a las 13:36
por usuario MichelleN
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84
Snakemake + tmux
Publicado el 11/12/2016 a las 14:26
por usuario domino55
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150
cuestiones LSF snakemake
Publicado el 13/12/2016 a las 07:38
por usuario naamako
Publicado el 14/12/2016 a las 00:57
por usuario kdmurrray91
Publicado el 16/12/2016 a las 08:31
por usuario bli
Publicado el 20/12/2016 a las 14:57
por usuario Jon
Publicado el 04/01/2017 a las 08:59
por usuario Gil Hornung
Publicado el 04/01/2017 a las 09:07
por usuario rioualen
Publicado el 12/01/2017 a las 12:49
por usuario vtrubets
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99
bibliotecas Globalmente carga R en Snakemake
Publicado el 13/01/2017 a las 12:01
por usuario Zuup
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428
Como llegar a la ruta del directorio de trabajo?
Publicado el 16/01/2017 a las 06:52
por usuario rioualen
Publicado el 17/01/2017 a las 08:55
por usuario Robyc
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453
usar múltiples parámetros en snakemake
Publicado el 20/01/2017 a las 11:16
por usuario Kam Sen
Publicado el 27/01/2017 a las 11:40
por usuario Zuup
Publicado el 15/02/2017 a las 11:08
por usuario bli
Publicado el 21/02/2017 a las 05:44
por usuario Zuup
Publicado el 06/03/2017 a las 10:42
por usuario Mesmer
Publicado el 08/03/2017 a las 10:27
por usuario Veera
Publicado el 16/03/2017 a las 09:21
por usuario bli
Publicado el 16/03/2017 a las 10:36
por usuario lvw
Publicado el 17/03/2017 a las 02:55
por usuario Kolja
Publicado el 22/03/2017 a las 00:56
por usuario RNA
Publicado el 24/03/2017 a las 13:18
por usuario Veera




Publicado el 28/03/2017 a las 11:14
por usuario lvw
Publicado el 30/03/2017 a las 12:51
por usuario crazyhottommy
Publicado el 10/04/2017 a las 12:01
por usuario Zen
Publicado el 12/04/2017 a las 11:00
por usuario msakya
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63
Snakemake: muestras con subtemas, cómo atraparlos?
Publicado el 07/05/2017 a las 10:43
por usuario hetica
Publicado el 11/05/2017 a las 07:22
por usuario tdido
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296
Edición Snakemake SGE Cluster Presentación
Publicado el 16/05/2017 a las 16:56
por usuario x.Doan
Publicado el 23/05/2017 a las 06:03
por usuario Anna Jeanine
Publicado el 24/05/2017 a las 21:54
por usuario TBoyarski
Publicado el 25/05/2017 a las 04:22
por usuario user3015703
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88
Usando pyenv en una regla snakemake
Publicado el 01/06/2017 a las 15:55
por usuario rbrisk
Publicado el 07/06/2017 a las 20:02
por usuario TBoyarski
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236
MissinOutputException en snakemake
Publicado el 09/06/2017 a las 04:32
por usuario Jokhe
Publicado el 15/06/2017 a las 03:23
por usuario user3015703
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116
snakemake error Thread.py
Publicado el 18/06/2017 a las 10:35
por usuario user3015703
Publicado el 22/06/2017 a las 10:24
por usuario user3015703
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108
Cómo acceder a la dict cluster_config dentro regla?
Publicado el 27/06/2017 a las 12:52
por usuario Jon
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80
Manténgase en remoto S3 RemoteProvider
Publicado el 27/06/2017 a las 12:56
por usuario K.Lai
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467
salida dinámica en snakemake
Publicado el 28/06/2017 a las 21:16
por usuario ate50eggs
Publicado el 04/07/2017 a las 10:04
por usuario Alexandre.S
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80
Snakemake: Envoltura Registro de comandos
Publicado el 11/07/2017 a las 21:04
por usuario sebio
Publicado el 14/07/2017 a las 17:26
por usuario Bruno Grande
Publicado el 21/07/2017 a las 16:09
por usuario Vivek-Bh
Publicado el 25/07/2017 a las 09:13
por usuario mau_who
Publicado el 26/07/2017 a las 12:58
por usuario bli
Publicado el 28/07/2017 a las 09:34
por usuario bli
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36
parámetros encadenados en SnakeMake
Publicado el 28/07/2017 a las 17:18
por usuario tedtoal
Publicado el 01/08/2017 a las 12:20
por usuario mau_who
Publicado el 02/08/2017 a las 22:20
por usuario TBoyarski
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64
Dónde informar sugerencias para SnakeMake
Publicado el 03/08/2017 a las 14:51
por usuario tedtoal
Publicado el 03/08/2017 a las 16:34
por usuario tedtoal
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475
snakemake comodines o ampliar comando
Publicado el 04/08/2017 a las 09:49
por usuario mau_who
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121
snakemake de configuración de acceso en la salida
Publicado el 04/08/2017 a las 14:16
por usuario Matt
Publicado el 07/08/2017 a las 14:44
por usuario tedtoal
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32
¿Cómo se accede a snakemake nombre del script?
Publicado el 07/08/2017 a las 18:33
por usuario tedtoal
Publicado el 08/08/2017 a las 12:39
por usuario Zuup
Publicado el 08/08/2017 a las 16:09
por usuario tedtoal
Publicado el 09/08/2017 a las 06:37
por usuario mau_who
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89
Snakemake: dynamic + salida no dinámico
Publicado el 09/08/2017 a las 16:10
por usuario Sean Colby
Publicado el 10/08/2017 a las 04:09
por usuario bli
Publicado el 10/08/2017 a las 08:33
por usuario rioualen
Publicado el 10/08/2017 a las 19:44
por usuario tedtoal
Publicado el 16/08/2017 a las 09:56
por usuario tdido
Publicado el 17/08/2017 a las 02:39
por usuario Jan Schreiber
Publicado el 17/08/2017 a las 17:08
por usuario yevishere
Publicado el 18/08/2017 a las 16:59
por usuario tedtoal
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31
tema en el soporte de comandos de grupo snakemake
Publicado el 18/08/2017 a las 17:42
por usuario yevishere
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53
La desconexión del flujo de trabajo
Publicado el 19/08/2017 a las 00:58
por usuario domino55
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35
MissingOutputException usando Python 3 y ReportLab
Publicado el 21/08/2017 a las 06:47
por usuario merella.stefania
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306
regla SnakeMake con Python guión, y el grupo Conda
Publicado el 21/08/2017 a las 12:15
por usuario Alistair Miles




Publicado el 21/08/2017 a las 16:42
por usuario yevishere
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85
Almacenar el resultado de un comando shell
Publicado el 28/08/2017 a las 05:01
por usuario khikho
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105
El uso de argparse en escritura Snakemake
Publicado el 30/08/2017 a las 19:57
por usuario JeeYem
Publicado el 31/08/2017 a las 16:44
por usuario tedtoal
Publicado el 31/08/2017 a las 18:54
por usuario user977828
Publicado el 05/09/2017 a las 18:00
por usuario tedtoal
Publicado el 05/09/2017 a las 23:57
por usuario mitoRibo
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119
comando touch Snakemake
Publicado el 06/09/2017 a las 06:13
por usuario mau_who
Publicado el 08/09/2017 a las 12:32
por usuario hardingnj
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37
archivo de proxy en código snakemake
Publicado el 11/09/2017 a las 10:11
por usuario mau_who
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134
Múltiples "params" en el archivo Snakemake
Publicado el 13/09/2017 a las 06:00
por usuario Michael Schubert
Publicado el 13/09/2017 a las 09:06
por usuario Michael Schubert
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50
Snakemake: regla de generar resultados extraños
Publicado el 19/09/2017 a las 08:53
por usuario user4249654
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80
snakemake cómo codificar Análisis de pares
Publicado el 19/09/2017 a las 17:56
por usuario mau_who
Publicado el 25/09/2017 a las 02:25
por usuario tedtoal
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117
normas Snakemake
Publicado el 25/09/2017 a las 02:43
por usuario jk_kim
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86
snakemake gestionar muestra par y indelrealigner
Publicado el 25/09/2017 a las 16:18
por usuario mau_who
Publicado el 26/09/2017 a las 08:51
por usuario mgalardini
Publicado el 26/09/2017 a las 09:36
por usuario Rewati Tappu
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1
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140
Las restricciones de entrada comodín Snakemake
Publicado el 30/09/2017 a las 20:58
por usuario Mike Dacre
Publicado el 02/10/2017 a las 11:45
por usuario hardingnj
Publicado el 03/10/2017 a las 21:24
por usuario bwubb
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148
El manejo de errores en SIGPIPE snakemake
Publicado el 04/10/2017 a las 11:56
por usuario dariober
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1
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57
el tiempo de latencia para snakemake
Publicado el 06/10/2017 a las 08:00
por usuario mau_who
Publicado el 08/10/2017 a las 13:12
por usuario sharchaea
Publicado el 08/10/2017 a las 18:50
por usuario tedtoal
Publicado el 12/10/2017 a las 12:25
por usuario David M
Publicado el 13/10/2017 a las 12:08
por usuario bwubb
Publicado el 18/10/2017 a las 11:03
por usuario bli
Publicado el 19/10/2017 a las 03:17
por usuario Kim
Publicado el 20/10/2017 a las 15:23
por usuario Sajber
Publicado el 20/10/2017 a las 16:14
por usuario Colin
Publicado el 24/10/2017 a las 06:32
por usuario Sajber
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1
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60
Recursividad / bucle de reglas en snakemake
Publicado el 26/10/2017 a las 02:38
por usuario Cerikson
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151
Cómo utilizar el ambiente por regla en snakemake?
Publicado el 26/10/2017 a las 03:43
por usuario A. Fust
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1
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24
Ignorar / cluster No usar para ciertas reglas
Publicado el 27/10/2017 a las 09:03
por usuario bwubb
Publicado el 02/11/2017 a las 21:44
por usuario SlowLearner
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45
snakemake filtrado de archivos dinámicos
Publicado el 03/11/2017 a las 05:23
por usuario Fenrir
Publicado el 03/11/2017 a las 13:22
por usuario bli
Publicado el 06/11/2017 a las 21:21
por usuario Cerikson
Publicado el 07/11/2017 a las 10:03
por usuario ezhao15
Publicado el 09/11/2017 a las 16:47
por usuario mau_who
Publicado el 09/11/2017 a las 23:16
por usuario tedtoal
Publicado el 12/11/2017 a las 07:44
por usuario pirovc
Publicado el 13/11/2017 a las 10:15
por usuario Carlus
Publicado el 13/11/2017 a las 11:32
por usuario Carlus
Publicado el 15/11/2017 a las 15:12
por usuario JeeYem
Publicado el 15/11/2017 a las 18:46
por usuario dugar
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23
Activación de las opciones en snakefile
Publicado el 20/11/2017 a las 12:52
por usuario tedtoal
Publicado el 20/11/2017 a las 18:13
por usuario Barry Moore




Publicado el 21/11/2017 a las 09:20
por usuario Kamil S Jaron
Publicado el 24/11/2017 a las 04:57
por usuario rioualen
Publicado el 29/11/2017 a las 09:50
por usuario l0o0
Publicado el 01/12/2017 a las 14:49
por usuario JeeYem
Publicado el 04/12/2017 a las 09:55
por usuario fiona
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103
cómo comodines en reglas, Snakemake
Publicado el 04/12/2017 a las 14:52
por usuario Yan W.
Publicado el 04/12/2017 a las 23:14
por usuario Hirak Sarkar
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34
Demasiados archivos en la carpeta `.snakemake`
Publicado el 12/12/2017 a las 07:24
por usuario Jan Schreiber
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21
cómo encontrar el repositorio adecuado
Publicado el 13/12/2017 a las 20:56
por usuario Anlin Li
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1
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65
Snakemake un comodín y también ampliar
Publicado el 18/12/2017 a las 11:36
por usuario par
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32
Snakemake: volver atrás y limpiar temp () archivos
Publicado el 19/12/2017 a las 09:29
por usuario Jonathan Manning
Publicado el 19/12/2017 a las 14:33
por usuario Bharat
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51
snakemake diferentes ambientes por subworkflow
Publicado el 22/12/2017 a las 04:32
por usuario Tjitske
Publicado el 28/12/2017 a las 01:29
por usuario Daniel Standage
Publicado el 28/12/2017 a las 09:15
por usuario rioualen
Publicado el 05/01/2018 a las 03:37
por usuario Anlin Li
Publicado el 05/01/2018 a las 06:05
por usuario rioualen
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1
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1
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92
Missing comodines en Objeto S4 snakemake en I
Publicado el 05/01/2018 a las 12:08
por usuario Patrick Roelli
Publicado el 09/01/2018 a las 07:18
por usuario Chris
Publicado el 09/01/2018 a las 13:16
por usuario fakechek
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1
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63
Regla no recogido por snakemake
Publicado el 10/01/2018 a las 10:29
por usuario yahan
Publicado el 11/01/2018 a las 16:16
por usuario user1973192
Publicado el 15/01/2018 a las 08:00
por usuario Julien Lagarde
Publicado el 19/01/2018 a las 10:57
por usuario Uri Laserson
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1
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49
expresión lambda en argumentos de entrada
Publicado el 21/01/2018 a las 11:16
por usuario khikho
Publicado el 23/01/2018 a las 23:18
por usuario Andreas
Publicado el 24/01/2018 a las 09:03
por usuario tfenne
Publicado el 25/01/2018 a las 04:55
por usuario yahan
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126
Snakemake: R guión falla (casi) inmediatamente
Publicado el 25/01/2018 a las 05:17
por usuario fakechek
Publicado el 25/01/2018 a las 08:03
por usuario bapors
Publicado el 25/01/2018 a las 14:50
por usuario seandavi
Publicado el 28/01/2018 a las 11:35
por usuario Lucas van Dijk
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55
memoria Snakemake limitando
Publicado el 31/01/2018 a las 07:33
por usuario bapors
Publicado el 31/01/2018 a las 22:00
por usuario Mike Dacre
Publicado el 01/02/2018 a las 12:07
por usuario anilbey
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19
Snakemake: JSON análisis multinivel
Publicado el 06/02/2018 a las 04:24
por usuario Nicolas Rosewick
Publicado el 07/02/2018 a las 12:30
por usuario user9328894
Publicado el 07/02/2018 a las 14:02
por usuario Thomas Moody
Publicado el 08/02/2018 a las 07:37
por usuario anilbey
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1
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44
InputFunctionException con KeyError
Publicado el 09/02/2018 a las 11:08
por usuario user3015703
Publicado el 09/02/2018 a las 15:34
por usuario K.Lai
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24
resultados extraños función de entrada snakemake
Publicado el 09/02/2018 a las 15:36
por usuario mau_who
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58
Snakemake: Error con el comodín inexistente
Publicado el 12/02/2018 a las 08:35
por usuario Nicolas Rosewick
Publicado el 14/02/2018 a las 05:03
por usuario user9328894
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1
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65
snakemake grupo o archivos de comodín
Publicado el 14/02/2018 a las 06:32
por usuario Nicolas Rosewick
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salida dinámica jerárquica en snakemake
Publicado el 15/02/2018 a las 07:08
por usuario kiero
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No Snakemake jugando muy bien con wget
Publicado el 15/02/2018 a las 19:35
por usuario conchoecia
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Snakemake: cómo cambiar pestaña literal
Publicado el 20/02/2018 a las 10:21
por usuario Nicolas Rosewick
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crear manualmente comodines snakemake
Publicado el 21/02/2018 a las 10:09
por usuario fakechek

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