Preguntas con etiquetas [snakemake]

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490
modo de emacs para snakemake?
Publicado el 15/06/2013 a las 18:08
por usuario user2489449
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89
error de puntero nulo y variable no definida
Publicado el 11/08/2015 a las 09:03
por usuario Marcel M
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476
Problemas con los pandas instalan - ejecutar varias versiones de Python
Publicado el 24/08/2015 a las 09:52
por usuario rioualen
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66
Bucle a través de listas de archivos con Bash - error de sintaxis
Publicado el 31/08/2015 a las 13:40
por usuario rioualen
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537
Ejecutar siempre en regla Snakefile (snakemake)
Publicado el 08/04/2016 a las 06:05
por usuario Chris
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202
la programación de tuberías en paralelo
Publicado el 17/06/2016 a las 14:21
por usuario VickiT05
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Proceso de múltiples directorios y todos los archivos dentro usando snakemake
Publicado el 21/06/2016 a las 16:27
por usuario VickiT05
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776
Re-escritura de archivos protegidos contra escritura
Publicado el 29/06/2016 a las 09:04
por usuario VickiT05
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231
¿Es posible obtener yapf ignorar partes de un archivo?
Publicado el 08/07/2016 a las 03:49
por usuario The Unfun Cat
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69
¿Por qué establecer `wildcard_constraints` en un snakefile prevenir el borrado de archivos marcados` temp`?
Publicado el 26/10/2016 a las 07:12
por usuario bli
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466
Cómo hacer expandir un parcial en Snakemake?
Publicado el 03/11/2016 a las 04:37
por usuario bli
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291
Snakemake puede evitar ambigüedades cuando dos caminos diferentes reglas pueden generar una salida dada?
Publicado el 09/11/2016 a las 10:19
por usuario bli
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86
El uso de "snakemake --config" pasar opciones a un comando
Publicado el 09/11/2016 a las 10:53
por usuario user3213137
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Nombre de la regla en lugar de archivo de destino: Snakemake
Publicado el 10/11/2016 a las 18:08
por usuario blaurent
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115
¿Cómo expresar reglas explícitas e implícitas en Snakemake?
Publicado el 13/11/2016 a las 05:13
por usuario Stephan
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237
El acceso a los archivos creados por normas snakemake log
Publicado el 15/11/2016 a las 00:49
por usuario Andreas
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656
¿cómo puedo pasar una cadena en el archivo de configuración en la sección de salida?
Publicado el 17/11/2016 a las 19:27
por usuario olala
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517
snakemake: cómo hacer frente a un número variable de salida de una regla
Publicado el 18/11/2016 a las 16:04
por usuario olala
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41
Bioconda: simulate-travis.py falla porque API no se puede importar de conda_build
Publicado el 20/11/2016 a las 21:28
por usuario Andreas
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95
Prevenir snakemake de hacer directorio de salida
Publicado el 21/11/2016 a las 16:36
por usuario Harold
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57
bioconda: No existe el fichero o directorio caliente con especias y construcción
Publicado el 22/11/2016 a las 10:39
por usuario Andreas
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213
Snakemake config clúster en combinación con DRMMA
Publicado el 23/11/2016 a las 11:43
por usuario fitziano
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346
Snakemake: dependencias que no son de entrada
Publicado el 25/11/2016 a las 05:27
por usuario blaurent
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96
Snakemake se queja de que no puede encontrar el archivo que se supone que crear en un plazo de instrucciones
Publicado el 02/12/2016 a las 11:09
por usuario bli
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snakemake: ¿hay una forma de especificar un directorio de salida para cada regla?
Publicado el 02/12/2016 a las 16:40
por usuario olala
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182
El nombre de la corriente de regla en Snakemake
Publicado el 05/12/2016 a las 08:59
por usuario glihm
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293
Snakemake: eliminar el archivo de salida
Publicado el 06/12/2016 a las 08:30
por usuario blaurent
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363
La reutilización de una regla en Snakemake
Publicado el 06/12/2016 a las 11:17
por usuario glihm
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49
Instalación snakemake sin internet
Publicado el 11/12/2016 a las 13:36
por usuario MichelleN
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84
Snakemake + tmux
Publicado el 11/12/2016 a las 14:26
por usuario domino55
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150
cuestiones LSF snakemake
Publicado el 13/12/2016 a las 07:38
por usuario naamako
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139
Snakemake las mejores prácticas para la demultiplexación
Publicado el 14/12/2016 a las 00:57
por usuario kdmurrray91
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510
Cómo utilizar expandirse en snakemake cuando no se desean unas combinaciones particulares de comodines?
Publicado el 16/12/2016 a las 08:31
por usuario bli
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47
Elegantemente manejar muestras con datos insuficientes en el flujo de trabajo?
Publicado el 20/12/2016 a las 14:57
por usuario Jon
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56
Definición de funciones para Geany "Tipo de archivo"
Publicado el 04/01/2017 a las 08:59
por usuario Gil Hornung
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299
El uso de expresiones regulares en snakemake comodines
Publicado el 04/01/2017 a las 09:07
por usuario rioualen
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123
Generar un número parametrizado de OutputFiles para una regla snakemake
Publicado el 12/01/2017 a las 12:49
por usuario vtrubets
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99
bibliotecas Globalmente carga R en Snakemake
Publicado el 13/01/2017 a las 12:01
por usuario Zuup
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428
Como llegar a la ruta del directorio de trabajo?
Publicado el 16/01/2017 a las 06:52
por usuario rioualen
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307
El procesamiento por lotes: GNU-haga, Snakemake o qué?
Publicado el 17/01/2017 a las 08:55
por usuario Robyc
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453
usar múltiples parámetros en snakemake
Publicado el 20/01/2017 a las 11:16
por usuario Kam Sen
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247
Snakemake: Orden aleatorio de comodines en la lista de comodines
Publicado el 27/01/2017 a las 11:40
por usuario Zuup
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106
Reutilización reglas y evitar CyclicGraphException con snakemake
Publicado el 15/02/2017 a las 11:08
por usuario bli
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475
Snakemake: el uso de expresiones regulares en ampliar ()
Publicado el 21/02/2017 a las 05:44
por usuario Zuup
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246
Snakemake: MissingInputException en la tubería snakemake
Publicado el 06/03/2017 a las 10:42
por usuario Mesmer
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461
¿Cómo obtener el nombre base de los valores comodín en la regla de salida snakemake?
Publicado el 08/03/2017 a las 10:27
por usuario Veera
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85
Son archivos definidos en la sección de registro de una regla snakemake muy diferente de los definidos en la sección de salida?
Publicado el 16/03/2017 a las 09:21
por usuario bli
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155
cómo pasar argumentos de comodín a Perl guión en snakefile?
Publicado el 16/03/2017 a las 10:36
por usuario lvw
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369
Reducir el conjunto de archivos de entrada de forma dinámica durante una carrera snakemake
Publicado el 17/03/2017 a las 02:55
por usuario Kolja
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136
`Bloque en el valor de configuración de restablecimiento snakemake run`?
Publicado el 22/03/2017 a las 00:56
por usuario RNA
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150
Snakemake elimina los archivos temporales antes de tiempo, mientras se ejecuta con la opción --immediate a presentar
Publicado el 24/03/2017 a las 13:18
por usuario Veera




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175
Implementación Cómo utilizar expandirse en snakemake cuando no se desean unas combinaciones particulares de comodines?
Publicado el 28/03/2017 a las 11:14
por usuario lvw
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81
cómo acceder a los comodines en una envoltura de clientes en snakemake
Publicado el 30/03/2017 a las 12:51
por usuario crazyhottommy
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396
Subproceso: No se puede convertir el objeto '_io.BufferedReader' implícitamente a STR
Publicado el 10/04/2017 a las 12:01
por usuario Zen
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89
Error: "atributos 'm_numa_nodes' no es un valor entero." cuando se ejecuta un snakemake qsub
Publicado el 12/04/2017 a las 11:00
por usuario msakya
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63
Snakemake: muestras con subtemas, cómo atraparlos?
Publicado el 07/05/2017 a las 10:43
por usuario hetica
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50
Snakemake: error sub-flujo de trabajo cuando se ejecuta en el grupo LSF
Publicado el 11/05/2017 a las 07:22
por usuario tdido
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296
Edición Snakemake SGE Cluster Presentación
Publicado el 16/05/2017 a las 16:56
por usuario x.Doan
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47
Conseguir secuencia basada en el locus etiqueta de identificación - SnakeMake
Publicado el 23/05/2017 a las 06:03
por usuario Anna Jeanine
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110
Configuración del clúster nombre de trabajo SGE con Snakemake durante el uso de DRMAA?
Publicado el 24/05/2017 a las 21:54
por usuario TBoyarski
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118
Cómo crear flujos de trabajo adecuados para su distribución en pitón
Publicado el 25/05/2017 a las 04:22
por usuario user3015703
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88
Usando pyenv en una regla snakemake
Publicado el 01/06/2017 a las 15:55
por usuario rbrisk
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43
El uso de '~' (También conocido como tilde) en la directiva de entrada no parece funcionar?
Publicado el 07/06/2017 a las 20:02
por usuario TBoyarski
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236
MissinOutputException en snakemake
Publicado el 09/06/2017 a las 04:32
por usuario Jokhe
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511
Múltiples entradas y salidas en un archivo Snakemake sola regla
Publicado el 15/06/2017 a las 03:23
por usuario user3015703
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116
snakemake error Thread.py
Publicado el 18/06/2017 a las 10:35
por usuario user3015703
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237
'No hay valores dados para el error comodín' en snakemake
Publicado el 22/06/2017 a las 10:24
por usuario user3015703
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108
Cómo acceder a la dict cluster_config dentro regla?
Publicado el 27/06/2017 a las 12:52
por usuario Jon
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80
Manténgase en remoto S3 RemoteProvider
Publicado el 27/06/2017 a las 12:56
por usuario K.Lai
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467
salida dinámica en snakemake
Publicado el 28/06/2017 a las 21:16
por usuario ate50eggs
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748
snakemake - salida de un archivo de sólo desde múltiples archivos de entrada en una regla
Publicado el 04/07/2017 a las 10:04
por usuario Alexandre.S
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80
Snakemake: Envoltura Registro de comandos
Publicado el 11/07/2017 a las 21:04
por usuario sebio
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61
solicitud de memoria por defecto con posibilidad de anulación en un Snakefile?
Publicado el 14/07/2017 a las 17:26
por usuario Bruno Grande
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123
cómo pasar una función bajo snakemake directiva de ejecución
Publicado el 21/07/2017 a las 16:09
por usuario Vivek-Bh
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90
snakemake configuation yaml para align BWA emparejado
Publicado el 25/07/2017 a las 09:13
por usuario mau_who
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108
La comprensión y la superación de AmbiguousRuleException en snakemake
Publicado el 26/07/2017 a las 12:58
por usuario bli
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49
tkinter RuntimeError utilizando matplotlib en un flujo de trabajo snakemake (sin GUI necesario)
Publicado el 28/07/2017 a las 09:34
por usuario bli
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36
parámetros encadenados en SnakeMake
Publicado el 28/07/2017 a las 17:18
por usuario tedtoal
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142
snakemake fusionar archivos bam después de la alineación BWA de 2 o más carriles
Publicado el 01/08/2017 a las 12:20
por usuario mau_who
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37
Cómo escribir reglas para el software con la versión de concha llamadas específicas? (Ej Samtools 1.3.1 y 0.1.18)
Publicado el 02/08/2017 a las 22:20
por usuario TBoyarski
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64
Dónde informar sugerencias para SnakeMake
Publicado el 03/08/2017 a las 14:51
por usuario tedtoal
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204
Sintaxis para utilizar los datos de configuración de reglas
Publicado el 03/08/2017 a las 16:34
por usuario tedtoal
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475
snakemake comodines o ampliar comando
Publicado el 04/08/2017 a las 09:49
por usuario mau_who
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121
snakemake de configuración de acceso en la salida
Publicado el 04/08/2017 a las 14:16
por usuario Matt
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788
forma recomendada de hacer múltiples shell comandos con la cáscara ()
Publicado el 07/08/2017 a las 14:44
por usuario tedtoal
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1
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32
¿Cómo se accede a snakemake nombre del script?
Publicado el 07/08/2017 a las 18:33
por usuario tedtoal
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66
Snakemake: Error durante la carga de bibliotecas compartidas - MSUB
Publicado el 08/08/2017 a las 12:39
por usuario Zuup
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4
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383
Puede snakemake valores de los parámetros de configuración sean cadenas con {<nombre>} valores a interpolar / ampliada?
Publicado el 08/08/2017 a las 16:09
por usuario tedtoal
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44
snakemake entender la interpretación yaml en el comando de alineación
Publicado el 09/08/2017 a las 06:37
por usuario mau_who
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89
Snakemake: dynamic + salida no dinámico
Publicado el 09/08/2017 a las 16:10
por usuario Sean Colby
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80
¿Cuáles son los archivos de metadatos snakemake? ¿Cuándo puedo borrar esos?
Publicado el 10/08/2017 a las 04:09
por usuario bli
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1
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99
¿Cuál sería una manera elegante de prevenir snakemake de fallar en caso de error cáscara / R?
Publicado el 10/08/2017 a las 08:33
por usuario rioualen
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1
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81
¿Hay una manera de reglas snakemake cadena sin archivos táctiles?
Publicado el 10/08/2017 a las 19:44
por usuario tedtoal
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25
Snakemake: hace referencia a la producción más allá de los padres en el escenario subworkflow recursiva
Publicado el 16/08/2017 a las 09:56
por usuario tdido
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99
Snakemake: función de entrada genérico para diferentes ubicaciones de archivos
Publicado el 17/08/2017 a las 02:39
por usuario Jan Schreiber
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26
Snakemake y la formación de nubes error cluster con el espacio del rasguño locales
Publicado el 17/08/2017 a las 17:08
por usuario yevishere
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13
SnakeMake: cómo determinar si se ejecuta como tarea inicial o posteriormente trabajo presentado?
Publicado el 18/08/2017 a las 16:59
por usuario tedtoal
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1
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31
tema en el soporte de comandos de grupo snakemake
Publicado el 18/08/2017 a las 17:42
por usuario yevishere
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53
La desconexión del flujo de trabajo
Publicado el 19/08/2017 a las 00:58
por usuario domino55
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35
MissingOutputException usando Python 3 y ReportLab
Publicado el 21/08/2017 a las 06:47
por usuario merella.stefania
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306
regla SnakeMake con Python guión, y el grupo Conda
Publicado el 21/08/2017 a las 12:15
por usuario Alistair Miles




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130
Cómo recopilar archivos de subdirectorios para ejecutar trabajos en Snakemake?
Publicado el 21/08/2017 a las 16:42
por usuario yevishere
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1
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85
Almacenar el resultado de un comando shell
Publicado el 28/08/2017 a las 05:01
por usuario khikho
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1
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105
El uso de argparse en escritura Snakemake
Publicado el 30/08/2017 a las 19:57
por usuario JeeYem
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135
SnakeMake puede ser obligado a volver a ejecutar reglas cuando faltan archivos
Publicado el 31/08/2017 a las 16:44
por usuario tedtoal
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1
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39
Cualquier vía de análisis escrito en forma de serpiente
Publicado el 31/08/2017 a las 18:54
por usuario user977828
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41
¿Puede el objeto de archivo de salida puede pasar a una función de entrada en SnakeMake?
Publicado el 05/09/2017 a las 18:00
por usuario tedtoal
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1
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89
Aceptando ligeramente diferentes entradas a snakemake regla (.fq vs .fq.gz)
Publicado el 05/09/2017 a las 23:57
por usuario mitoRibo
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119
comando touch Snakemake
Publicado el 06/09/2017 a las 06:13
por usuario mau_who
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93
Muchas entradas a una salida, comodines de acceso en los archivos de entrada
Publicado el 08/09/2017 a las 12:32
por usuario hardingnj
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37
archivo de proxy en código snakemake
Publicado el 11/09/2017 a las 10:11
por usuario mau_who
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134
Múltiples "params" en el archivo Snakemake
Publicado el 13/09/2017 a las 06:00
por usuario Michael Schubert
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132
Cómo traducir una simple regla patrón objetivo a snakemake?
Publicado el 13/09/2017 a las 09:06
por usuario Michael Schubert
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1
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50
Snakemake: regla de generar resultados extraños
Publicado el 19/09/2017 a las 08:53
por usuario user4249654
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1
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80
snakemake cómo codificar Análisis de pares
Publicado el 19/09/2017 a las 17:56
por usuario mau_who
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132
Snakemake rutas de archivos absolutas no reconocidas en regla cuando la ruta del archivo especificado como objetivo
Publicado el 25/09/2017 a las 02:25
por usuario tedtoal
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1
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117
normas Snakemake
Publicado el 25/09/2017 a las 02:43
por usuario jk_kim
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86
snakemake gestionar muestra par y indelrealigner
Publicado el 25/09/2017 a las 16:18
por usuario mau_who
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6
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217
Cómo llevar a cabo operaciones de cadenas simples de salida snakemake
Publicado el 26/09/2017 a las 08:51
por usuario mgalardini
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1
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92
Snakemake: CalledProcessError cuando se ejecuta BWA en varios archivos
Publicado el 26/09/2017 a las 09:36
por usuario Rewati Tappu
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1
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140
Las restricciones de entrada comodín Snakemake
Publicado el 30/09/2017 a las 20:58
por usuario Mike Dacre
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78
snakemake: leer argumentos de línea de comandos de archivos de entrada
Publicado el 02/10/2017 a las 11:45
por usuario hardingnj
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131
Snakemake MissingOutputException latencia-wait ignorado
Publicado el 03/10/2017 a las 21:24
por usuario bwubb
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148
El manejo de errores en SIGPIPE snakemake
Publicado el 04/10/2017 a las 11:56
por usuario dariober
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57
el tiempo de latencia para snakemake
Publicado el 06/10/2017 a las 08:00
por usuario mau_who
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41
Snakemake puede dar prioridad a la ejecución por muestra?
Publicado el 08/10/2017 a las 13:12
por usuario sharchaea
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75
Es la función Snakemake params evaluado antes de la existencia del archivo de entrada?
Publicado el 08/10/2017 a las 18:50
por usuario tedtoal
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444
Snakemake: ¿Cómo se utiliza una función que toma en un comodín y devuelve un valor?
Publicado el 12/10/2017 a las 12:25
por usuario David M
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46
el acceso adecuadamente cluster_config '' valores __default__
Publicado el 13/10/2017 a las 12:08
por usuario bwubb
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122
Significado de las variables de referencia en snakemake
Publicado el 18/10/2017 a las 11:03
por usuario bli
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41
Snakemake es la herramienta adecuada para utilizar para el manejo de los flujos de trabajo de salida mediada
Publicado el 19/10/2017 a las 03:17
por usuario Kim
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108
Snakemake: Las entradas se fusionan con diferentes sufijos a la salida del mismo sufijo
Publicado el 20/10/2017 a las 15:23
por usuario Sajber
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99
No se puede obtener esta expresión regular para trabajar por wildcard_constraints en snakemake
Publicado el 20/10/2017 a las 16:14
por usuario Colin
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134
SLURM / Sbatch crea muchos archivos pequeños de salida
Publicado el 24/10/2017 a las 06:32
por usuario Sajber
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60
Recursividad / bucle de reglas en snakemake
Publicado el 26/10/2017 a las 02:38
por usuario Cerikson
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151
Cómo utilizar el ambiente por regla en snakemake?
Publicado el 26/10/2017 a las 03:43
por usuario A. Fust
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24
Ignorar / cluster No usar para ciertas reglas
Publicado el 27/10/2017 a las 09:03
por usuario bwubb
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28
Regla vs especificación de recursos línea de comandos para el uso del clúster
Publicado el 02/11/2017 a las 21:44
por usuario SlowLearner
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45
snakemake filtrado de archivos dinámicos
Publicado el 03/11/2017 a las 05:23
por usuario Fenrir
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69
objeto 'InputFiles' no tiene atributo <X> cuando se utiliza una función como entrada para una regla snakemake
Publicado el 03/11/2017 a las 13:22
por usuario bli
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115
snakemake: comodines están cambiando en función de entrada
Publicado el 06/11/2017 a las 21:21
por usuario Cerikson
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42
Asegurando un empleo por cada nodo para una regla específica
Publicado el 07/11/2017 a las 10:03
por usuario ezhao15
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48
snakemake: regla de mango conectar en el modo incorrecto en otra regla
Publicado el 09/11/2017 a las 16:47
por usuario mau_who
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51
¿Cómo puede ser hecho Snakemake para actualizar los archivos de una manera jerárquica basada en reglas, cuando un nuevo archivo aparece en la parte inferior de la jerarquía?
Publicado el 09/11/2017 a las 23:16
por usuario tedtoal
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78
¿Cómo obtener la ruta del entorno Conda dentro de una regla?
Publicado el 12/11/2017 a las 07:44
por usuario pirovc
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180
utilizando entornos CONDA en flujos de trabajo snakemake simples
Publicado el 13/11/2017 a las 10:15
por usuario Carlus
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14
Gatillo snakemake regla de ejecución al actualizar db referencia
Publicado el 13/11/2017 a las 11:32
por usuario Carlus
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123
Uso de variables en el archivo de configuración Snakefile [snakemake]
Publicado el 15/11/2017 a las 15:12
por usuario JeeYem
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85
Snakemake en clúster, evitar la presentación de una regla como un trabajo
Publicado el 15/11/2017 a las 18:46
por usuario dugar
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23
Activación de las opciones en snakefile
Publicado el 20/11/2017 a las 12:52
por usuario tedtoal
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19
Múltiples instancias de regla con FTP.remote como entrada
Publicado el 20/11/2017 a las 18:13
por usuario Barry Moore




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90
¿Es posible imprimir los comandos en lugar de reglas en snakemake marcha en seco?
Publicado el 21/11/2017 a las 09:20
por usuario Kamil S Jaron
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39
Cómo sobrescribir un parámetro de la configfile que no está en el primer nivel en una llamada snakemake?
Publicado el 24/11/2017 a las 04:57
por usuario rioualen
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36
Cómo hacer coincidir Identificación del trabajo a un script de shell regla
Publicado el 29/11/2017 a las 09:50
por usuario l0o0
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51
Snakemake - LSF Override (BSUB) config clúster de una manera regla específica
Publicado el 01/12/2017 a las 14:49
por usuario JeeYem
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55
snakemake: no es compatible con R 3.4.0 (crear el ambiente)
Publicado el 04/12/2017 a las 09:55
por usuario fiona
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103
cómo comodines en reglas, Snakemake
Publicado el 04/12/2017 a las 14:52
por usuario Yan W.
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49
¿Cómo mantener el archivo de la cáscara snakemake mientras se ejecuta en racimo
Publicado el 04/12/2017 a las 23:14
por usuario Hirak Sarkar
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34
Demasiados archivos en la carpeta `.snakemake`
Publicado el 12/12/2017 a las 07:24
por usuario Jan Schreiber
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21
cómo encontrar el repositorio adecuado
Publicado el 13/12/2017 a las 20:56
por usuario Anlin Li
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65
Snakemake un comodín y también ampliar
Publicado el 18/12/2017 a las 11:36
por usuario par
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32
Snakemake: volver atrás y limpiar temp () archivos
Publicado el 19/12/2017 a las 09:29
por usuario Jonathan Manning
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192
Utilizando para el bucle en reglas y errores con comando shell dividida
Publicado el 19/12/2017 a las 14:33
por usuario Bharat
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51
snakemake diferentes ambientes por subworkflow
Publicado el 22/12/2017 a las 04:32
por usuario Tjitske
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75
Acceso anidado variables de configuración en una regla
Publicado el 28/12/2017 a las 01:29
por usuario Daniel Standage
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146
No se puede importar el módulo Python utilizando un entorno Conda en la regla Snakemake
Publicado el 28/12/2017 a las 09:15
por usuario rioualen
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26
Snakemake única re-ejecuta los trabajos si uno de los archivos de entrada es más reciente que uno de los archivos de salida o uno de los archivos de entrada será actualizado por el otro puesto de trabajo
Publicado el 05/01/2018 a las 03:37
por usuario Anlin Li
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19
Cómo acceder a la configfile de un subworkflow del flujo de trabajo de los padres en snakemake?
Publicado el 05/01/2018 a las 06:05
por usuario rioualen
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92
Missing comodines en Objeto S4 snakemake en I
Publicado el 05/01/2018 a las 12:08
por usuario Patrick Roelli
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62
Determinante en Snakefile si se ejecuta en modo de clúster o no
Publicado el 09/01/2018 a las 07:18
por usuario Chris
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97
Snakemake: Cómo guardar y detalles de la muestra en el acceso de archivos config.yml?
Publicado el 09/01/2018 a las 13:16
por usuario fakechek
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63
Regla no recogido por snakemake
Publicado el 10/01/2018 a las 10:29
por usuario yahan
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44
Solución para todo gobierno y la sintaxis `rules.rule_A.output.output_X`
Publicado el 11/01/2018 a las 16:16
por usuario user1973192
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157
Cómo utilizar expandirse en snakemake cuando no se desean algunas combinaciones de comodines (que faltan archivos de entrada), con una regla de "fusión"?
Publicado el 15/01/2018 a las 08:00
por usuario Julien Lagarde
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37
Snakemake puede resolver normas ambiguas mediante la especificación de archivos de salida intermedios?
Publicado el 19/01/2018 a las 10:57
por usuario Uri Laserson
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49
expresión lambda en argumentos de entrada
Publicado el 21/01/2018 a las 11:16
por usuario khikho
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40
Snakemake en el modo de clúster con --no-fs-compartida: Cómo establecer el estado de clúster
Publicado el 23/01/2018 a las 23:18
por usuario Andreas
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56
Cómo establecer las discusiones función del número de núcleos disponibles?
Publicado el 24/01/2018 a las 09:03
por usuario tfenne
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57
snakemake puede elegir un archivo de configuración basado en un parámetro?
Publicado el 25/01/2018 a las 04:55
por usuario yahan
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126
Snakemake: R guión falla (casi) inmediatamente
Publicado el 25/01/2018 a las 05:17
por usuario fakechek
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147
El uso de múltiples nombres de archivo como comodines en Snakemake
Publicado el 25/01/2018 a las 08:03
por usuario bapors
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34
¿Cómo puedo controlar "recursos" durante un ciclo de flujo de trabajo snakemake?
Publicado el 25/01/2018 a las 14:50
por usuario seandavi
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63
SH: No se ha encontrado comando al utilizar los perfiles Snakemake
Publicado el 28/01/2018 a las 11:35
por usuario Lucas van Dijk
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55
memoria Snakemake limitando
Publicado el 31/01/2018 a las 07:33
por usuario bapors
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32
El uso de otros archivos basado en las salidas dinámicas con comodines no dinámicos mixtos en snakemake
Publicado el 31/01/2018 a las 22:00
por usuario Mike Dacre
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45
Snakemake sugerencias sobre el diseño de flujo de trabajo para superar las normas ambiguas
Publicado el 01/02/2018 a las 12:07
por usuario anilbey
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19
Snakemake: JSON análisis multinivel
Publicado el 06/02/2018 a las 04:24
por usuario Nicolas Rosewick
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29
Dos variables con nombres inconsistentes como entrada para una regla Snakemake
Publicado el 07/02/2018 a las 12:30
por usuario user9328894
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148
Q: reglas de destino no pueden contener errores comodines en Snakemake - No hay comodines en destino?
Publicado el 07/02/2018 a las 14:02
por usuario Thomas Moody
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72
snakemake tanto shell I / O redirección y acceder snakemake variable usando la escritura
Publicado el 08/02/2018 a las 07:37
por usuario anilbey
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44
InputFunctionException con KeyError
Publicado el 09/02/2018 a las 11:08
por usuario user3015703
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17
¿Hay algún cambio significativo en la forma en que debemos escribir snakemake reglas usando S3.remote cuando se cambia de boto a boto3?
Publicado el 09/02/2018 a las 15:34
por usuario K.Lai
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24
resultados extraños función de entrada snakemake
Publicado el 09/02/2018 a las 15:36
por usuario mau_who
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58
Snakemake: Error con el comodín inexistente
Publicado el 12/02/2018 a las 08:35
por usuario Nicolas Rosewick
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39
Haciendo uso snakemake como entrada 2 salidas de una regla con diferentes nombres
Publicado el 14/02/2018 a las 05:03
por usuario user9328894
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65
snakemake grupo o archivos de comodín
Publicado el 14/02/2018 a las 06:32
por usuario Nicolas Rosewick
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66
salida dinámica jerárquica en snakemake
Publicado el 15/02/2018 a las 07:08
por usuario kiero
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41
No Snakemake jugando muy bien con wget
Publicado el 15/02/2018 a las 19:35
por usuario conchoecia
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33
Snakemake: cómo cambiar pestaña literal
Publicado el 20/02/2018 a las 10:21
por usuario Nicolas Rosewick
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79
crear manualmente comodines snakemake
Publicado el 21/02/2018 a las 10:09
por usuario fakechek

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